Na úrovní Evropy je ČCE členem těchto ekumenických organizací:
bylo založeno jako Leuenberské společenství (Leuenberger Concordie) podle města Leuenberg ve Švýcarsku, kde společenství vzniklo v roce 1973. Podílejí se na něm od počátku evangelické církve augsburského i helvetského vyznání i anglikánská církev. Dnes k němu patří i Československá církev husitská. Společenství evangelických církví v Evropě má svou kancelář ve Vídni. Členské církve v České republice se scházejí každé dva až tři roky při leuenberském synodu v ČR.
vznikla roku 1959 a dnes sdružuje 123 evropských církví těchto vyznání: baptisté, luteráni, metodisté, pravoslavní, reformovaní, starokatolíci i letniční a 25 přidružených organizací. Sídlo má v Ženevě, v Bruselu a Štrasburku.